在日本的太平洋外海上有座名為「天尊」的人工島，在當時首位女性總理大臣封龍寺常盤子的提倡下成立了一所全新學園「天尊學園」，表面上是為了培育真正日本女性的精英學校。主角•雨洲九未為了查出大姐•十和死亡的真相而轉學至此，沒想到卻是她苦難的開端。在這裡校規代表了一切，但是到了放學後卻連校規都不再適用，每個學生為了爭奪對方的校徽可以不擇手段，甚至將對方殺了都在所不惜。